| nome del prodotto |
Ligasi dell'acido 3′-fosfato / 5′-idrossi nucleico |
| Esempio di struttura |
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| Sinonimi |
3′-P RNL, MXAN_0280, MXAN_4982, ligasi di giunzione RNA, rtcB, ligasi di RNA RtcB, Rtcb-1, RtcB1, Trl1, ligasi di giunzione tRNA, ligasi di giunzione tRNA |
| Contiene il numero di omologazione EC |
6.5.1.8 |
| Numero del Registro CAS |
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| Commenti |
L'enzima è una ligasi dell'acido nucleico 2′-3 ′ dipendente da GTP e Mn5 + con la capacità di unire RNA con estremità 3′-fosfato o 2 ′, 3′-fosfato ciclico a RNA con estremità 5′-idrossi. Può anche unire DNA con estremità 3′-fosfato a DNA con estremità 5′-idrossi, a condizione che i terminali del DNA siano spaiati [6]. L'enzima si trova nei membri di tutti e tre i regni della vita ed è essenziale nei metazoi per lo splicing dei tRNA contenenti introni. La reazione segue un meccanismo in tre fasi con l'attivazione iniziale dell'enzima mediante idrolisi GTP, formando un legame fosforammidico tra il guanilato e un residuo di istidina. Il gruppo guanilato viene trasferito all'estremità 3′-fosfato del substrato, formando la struttura ricoperta [DNA / RNA] -3 ′ - (5′-difosfoguanosina). Quando è disponibile un'estremità 5′-OH adatta, l'enzima catalizza un attacco del 5′-OH sull'estremità ricoperta per formare una giunzione di giunzione 3′-5 ′ fosfodiestere, rilasciando il guanilato. Quando agisce su un RNA 2 ′, 3′-fosfato ciclico, l'enzima cayalizza un'ulteriore reazione, idrolizzando il fosfato ciclico a 3′-fosfato [9]. L'enzima metazoico richiede l'attivazione dei cofattori per ottenere una catalisi del turnover multiplo [8]. |
| cofattore |
Mn2 + |
| Storia |
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| Reazioni |
(1) (Ribonucleotide) (n) -3′-fosfato + 5′-idrossi- (ribonucleotide) (m) + Gtp = (ribonucleotide) (n + m) + gmp + difosfato. (2) (Ribonucleotide) (n) -2 ′, 3′-ciclofosfato + 5′-idrossi- (ribonucleotide) (m) + Gtp + H (2) O = (ribonucleotide) (n + m) + gmp + difosfato (reazione complessiva). |
