DNA ligasi (ATP o NAD+) EC#: 6.5.1.6; ChemWhat Codice: 1383898

Ürün Adı DNA ligasi (ATP o NAD +)
Esempio di struttura Esempio di struttura della DNA ligasi (ATP o NAD +) N. CE: 6.5.1.6
Sinonimi Tfu DNA ligasi
Contiene il numero di omologazione EC 6.5.1.6
Numero del Registro CAS
Commenti Gli enzimi degli archaea "Thermococcus fumicolans" e "Thermococcus onnurineus" mostrano un'attività elevata con ATP o NAD + e un'attività significativamente inferiore con TTP, GTP e CTP. L'enzima catalizza la legatura dei filamenti di DNA con i terminali 3′-idrossile e 5′-fosfato, formando un fosfodiestere e sigillando alcuni tipi di rotture a filamento singolo nel DNA duplex. La catalisi avviene mediante un meccanismo a tre fasi, a partire dall'attivazione dell'enzima da parte di ATP o NAD +, formando un legame fosforammidico tra l'adenilato e un residuo di lisina. Il gruppo adenilato viene quindi trasferito all'estremità 5′-fosfato del substrato, formando la struttura ricoperta 5 ′ - (5′-difosfoadenosina) - [DNA]. Infine, l'enzima catalizza un attacco nucleofilo del terminale 3′-OH sul terminale ricoperto, che si traduce nella formazione del legame fosfodiestere e nel rilascio dell'adenilato. Diverso da EC? 6.5.1.1, DNA ligasi (ATP), EC? 6.5.1.2, DNA ligasi (NAD +) e EC? 6.5.1.7, DNA ligasi (ATP, ADP o GTP).
cofattore
Storia
Reazioni (1) Atp + (desossiribonucleotide) (n) -3′-idrossile + 5′-fosfo- (desossiribonucleotide) (m) = (desossiribonucleotide) (n + m) + Amp + difosfato. (2) NAD (+) + (desossiribonucleotide) (n) -3′-idrossile + 5′-fosfo- (desossiribonucleotide) (m) = (desossiribonucleotide) (n + m) + Amp + beta-nicotinammide D-nucleotide.

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