DNA ligasi (ATP, ADP o GTP) EC#: 6.5.1.7; ChemWhat Codice: 1383899

Ürün Adı DNA ligasi (ATP, ADP o GTP)
Esempio di struttura Esempio di struttura della DNA ligasi (ATP, ADP o GTP) N. CE: 6.5.1.7
Sinonimi DNA ligasi di Hbu, DNA ligasi cofattore-dipendente multiplo, DNA ligasi di Szi
Contiene il numero di omologazione EC 6.5.1.7
Numero del Registro CAS
Commenti Gli enzimi dell'archaea "Hyperthermus butylicus" e "Sulfophobococcus zilligii" sono attivi con ATP, ADP o GTP. Non mostrano attività con NAD +. L'enzima catalizza la legatura dei filamenti di DNA con i terminali 3′-idrossile e 5′-fosfato, formando un fosfodiestere e sigillando alcuni tipi di rotture a filamento singolo nel DNA duplex. La catalisi avviene mediante un meccanismo in tre fasi, a partire dall'attivazione dell'enzima da parte di ATP, ADP o GTP, formando un legame fosforammidico tra adenilato / guanilato e un residuo di lisina. Il nucleotide viene quindi trasferito all'estremità 5′-fosfato del substrato, formando la struttura ricoperta 5 ′ - (5′-difosfoadenosina / guanosina) - [DNA]. Infine, l'enzima catalizza un attacco nucleofilo del terminale 3′-OH sul terminale ricoperto, che si traduce nella formazione del legame fosfodiestere e nel rilascio del nucleotide. Diverso da EC? 6.5.1.1, DNA ligasi (ATP) e EC? 6.5.1.6, DNA ligasi (ATP o NAD +), che non possono utilizzare GTP.
cofattore
Storia
Reazioni (1) Atp + (desossiribonucleotide) (n) -3′-idrossile + 5′-fosfo- (desossiribonucleotide) (m) = (desossiribonucleotide) (n + m) + Amp + difosfato. (2) Adp + (desossiribonucleotide) (n) -3′-idrossile + 5′-fosfo- (desossiribonucleotide) (m) = (desossiribonucleotide) (n + m) + Amp + fosfato. (3) Gtp + (desossiribonucleotide) (n) -3′-idrossile + 5′-fosfo- (desossiribonucleotide) (m) = (desossiribonucleotide) (n + m) + Gmp + difosfato.

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